A megfelelő szűrőrendszer elengedhetetlen a növényegészség és az eltömődésmentes termesztési idényekhez. Különösen a precíziós öntözőberendezések, amelyek csepegtetőket vagy mikro szórófejeket használnak, érzékenyek a tápvízben lévő homokszemcsékre . Az öntözővíz magas vas- és mangánkoncentráció szintén eltömítheti a rendszert, ezért szükséges az eltávolítása. Ha az eltömődés már kialakult, előfordulhat, hogy a csepegtető öntözés oldalágait teljesen ki kell cserélni.
Figyelembe véve az öntözési módszert, a rendszer méretét és hidraulikai kapacitását, valamint az öntözővíz tulajdonságait, kiválaszthatjuk a szűrőrendszer vagy a leválasztó berendezéseket, amelyek révén a karbantartás minimálisra csökkenthető, a rendszer élettartama és a növényegészség maximálisra fokozható.